衣原体是一群体积较小，能通过细菌滤器，细胞内专性寄生，并有独特发育周期的原核细胞型微生物。人类衣原体病主要包括：
   一、沙眼衣原体（Ct）
   1、沙眼  由沙眼生物亚种A、B、Ba和C四个血清型引起。主要通过眼手眼的途径直接或间接接触传播。
   2、包涵体结膜炎  由沙眼生物亚种B、Ba、D、Da、E、F、G、H、I、Ia、J、K血清型引起。包括婴儿及成人两类。婴儿经产道时该亚种可致包涵体结膜炎和婴儿肺炎。
   3、泌尿生殖道感染  主要由生物亚种D--K血清型引起，是经性接触传播引起的非淋菌性泌尿生殖道感染的主要病原。衣原体感染是男性尿道炎最常见的病因之一。未经治疗者多数转为慢性，周期性加重，或可合并附睾炎、前列腺炎等。在女性可引起尿道炎、宫颈炎、阴道炎、盆腔炎，也可与妇女不孕症有关。衣原体常与淋病奈瑟菌混合感染，淋病奈瑟菌对衣原体的繁殖起激活和促进作用。
   4、性病淋巴肉肿   由沙眼衣原体LGV生物亚种L血清型引起，主要通过性接触传播。引起以化脓性腹股沟淋巴结炎。
   二、鹦鹉热衣原体：主要引起鸟类或家禽感染，由感染该衣原体的鸟类等动物的粪便污染环境，以气溶胶形式传给人。使人发生上呼吸道感染肺炎和毒血症。典型临床表现为非典性肺炎。
   三、肺炎衣原体：其传播方式主要是人与人之间经飞沫或呼吸道分泌物传播。引起青少年急性呼吸道感染，以肺炎为主，常可呈地方性、散发性流行，也可引起支气管炎、咽炎等。该衣原体也可引起慢性感染，其与急性心急梗死和慢性冠心病的关系越来越引起注意。